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高等教育領(lǐng)域數(shù)字化綜合服務(wù)平臺
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新冠病毒傳播建模預(yù)測和模擬推演平臺
近日，南科大“人流大數(shù)據(jù)和AI驅(qū)動的新型冠狀病毒（COVID-19）傳播建模預(yù)測和模擬推演平臺”內(nèi)測版本正式推出（下簡稱“推演平臺”）。該平臺可實現(xiàn)在城市尺度上，基于人流移動的新型冠狀病毒傳播感染情況的細(xì)粒度預(yù)測和模擬，為有關(guān)部門制定不同的隔離和公共防疫政策（如封閉特定城市區(qū)域或道路）提供參考。新型冠狀病毒的感染傳播與人流移動存在密不可分的關(guān)聯(lián)?，F(xiàn)階段的多數(shù)研究只停留在簡單的相關(guān)性分析以及基于全國地圖的數(shù)據(jù)可視化階段，缺乏在城市尺度上、針對人流移動的細(xì)粒度深度分析，更缺乏基于人流移動的傳播模擬推演模型以及潛在感染源和風(fēng)險區(qū)域的挖掘模型。隨著復(fù)工潮的來臨，戰(zhàn)“疫”面臨新的挑戰(zhàn)。南方科技大學(xué)科研部、工學(xué)院、計算機(jī)科學(xué)與工程系（下簡稱“計算機(jī)系”）和南方科技大學(xué)-東京大學(xué)超智慧城市聯(lián)合研究中心緊急組織科研力量，成立“新型冠狀病毒傳播建模預(yù)測項目組”，由計算機(jī)系副教授宋軒擔(dān)任負(fù)責(zé)人，迅速啟動針對新型冠狀病毒傳播感染的“大數(shù)據(jù)分析和AI建模推演平臺”研發(fā)工作。該平臺是一個針對新型冠狀病毒傳播的大數(shù)據(jù)分析和AI建模平臺（如圖1），其中預(yù)測和模擬推演模型完全由數(shù)據(jù)驅(qū)動，需要使用人流大數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練和優(yōu)化。數(shù)據(jù)擁有單位只要將人流大數(shù)據(jù)輸入平臺，平臺即可以自動完成模型迭代訓(xùn)練，并輸出相關(guān)的預(yù)測和模擬推演的可視化結(jié)果。其預(yù)測和模擬推演的精度由模型訓(xùn)練數(shù)據(jù)的質(zhì)量、精細(xì)度和覆蓋度決定。平臺后續(xù)期待更多單位（如GPS軌跡數(shù)據(jù)、CDR數(shù)據(jù)等人流大數(shù)據(jù)擁有單位）參與進(jìn)來，共同完善該平臺。推演平臺通過整合、處理和分析各類多模態(tài)人流移動和出行大數(shù)據(jù)，結(jié)合新一代的人工智能技術(shù)，完成對新型冠狀病毒的傳播和感染人群細(xì)粒度建模，從而實現(xiàn)在城市區(qū)域內(nèi)細(xì)粒度預(yù)測、模擬和動態(tài)推演傳播感染情況。平臺可實現(xiàn)的基本功能主要有以下幾個方面：一是建立新型冠狀病毒和人流移動的映射模型，包括傳染概率確定/潛伏期分析/傳染代數(shù)分析等；二是分析隱藏病患，由于疾病傳播為鏈?zhǔn)?，可以根?jù)缺失軌跡鏈反推出尚未確診的疑似病患；三是分析風(fēng)險人群，可根據(jù)病患軌跡尋找可能有接觸的風(fēng)險人群，提前預(yù)警；四是挖掘潛在病原地，分析病人間的軌跡交叉點確認(rèn)潛在的未知病原地（如圖3）。在以上功能基礎(chǔ)上，平臺可以實現(xiàn)設(shè)定不同的公共防疫政策（如封閉城市內(nèi)的高風(fēng)險感染區(qū)域），在城市尺度上，動態(tài)推演和模擬在這些政策下的城市傳播感染情況，從而幫助相關(guān)部門制定更為高效的隔離和公共防疫政策（如圖4）。
南方科技大學(xué)
2021-04-10
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一步法病毒RNA提取試劑
福州大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院林峻博士在第一代“新型冠狀病毒檢測試劑盒”的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步研發(fā)出“一步法病毒RNA提取試劑”。
福州大學(xué)
2021-04-10
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醫(yī)院病房空氣中檢出新冠病毒的研究
根據(jù)《新型冠狀病毒肺炎流行病學(xué)特征分析》報告，截至2月11日，共有3019名醫(yī)務(wù)人員感染了新型冠狀病毒（包括確診病例、疑似病例、臨床診斷病例及無癥狀感染者，其中確診病例1716名）。新冠肺炎來勢洶洶，眾多醫(yī)護(hù)人員依然奮戰(zhàn)在臨床一線參與救治。然而，新冠病毒的高傳播風(fēng)險和感染率為醫(yī)院防控和醫(yī)護(hù)人員的防護(hù)提出了新的挑戰(zhàn)。吉林大學(xué)第一醫(yī)院華樹成教授團(tuán)隊，采集了吉林大學(xué)第一醫(yī)院隔離病房、發(fā)熱門診、導(dǎo)診臺等處空氣、物表、門把手等樣本，以及密切接觸新冠患者的醫(yī)護(hù)人員樣本，使用RT-PCR法對樣本中的新型冠狀病毒核酸進(jìn)行了檢測。2月27日，該研究以Clinical Data on Hospital Environmental Hygiene Monitoring and Medical Staffs Protection during the Coronavirus Disease 2019 Outbreak為題，發(fā)表在醫(yī)學(xué)預(yù)印本網(wǎng)站medRxiv上。檢測結(jié)果顯示，疑似患者隔離區(qū)的護(hù)士站的表面，以及重癥監(jiān)護(hù)病房的空氣中，都檢測到了新冠病毒。論文中提示，核酸檢測可用于醫(yī)院環(huán)境監(jiān)測，并提示了醫(yī)院環(huán)境中存在新冠病毒的可能原因及潛在風(fēng)險，為流行性疾病疫情期間醫(yī)院的感控和醫(yī)護(hù)人員的防護(hù)提供了依據(jù)。研究人員從吉林大學(xué)第一醫(yī)院的導(dǎo)診臺、發(fā)熱門診和隔離病房區(qū)域收集了158個空氣和物體表面樣本（空氣樣本28個，物體表面樣本130個），這些樣本很可能被確診患者和疑似患者所污染。檢測結(jié)果顯示，重癥監(jiān)護(hù)室的空氣中存在病毒，疑似患者隔離區(qū)的護(hù)士站的表面也檢測到了病毒?？諝鈽颖镜年栃月史謩e為3.57％（1/28），表面樣品的陽性率為0.77％（1/130），總陽性率為1.26％（2/158）。這些發(fā)現(xiàn)表明，病毒既存在于物體表面又存在于空氣中。護(hù)士站物體表面檢測到新冠病毒 重癥監(jiān)護(hù)室空氣中檢測到新冠病毒這項研究結(jié)果表明，在疫情爆發(fā)期，對醫(yī)院環(huán)境衛(wèi)生的全面監(jiān)控有利于完善醫(yī)院的感染控制，通過檢測醫(yī)院環(huán)境衛(wèi)生，對確保醫(yī)療安全和醫(yī)院感染控制質(zhì)量具有重要意義。
吉林大學(xué)
2021-04-11
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新型冠狀病毒疫苗和檢測技術(shù)研究
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合鄭州大學(xué)、河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動物免疫學(xué)重點實驗室等三個實驗室的優(yōu)勢資源，組織精干研究團(tuán)隊，緊急啟動新型冠狀病毒疫苗和檢測技術(shù)研究工作。 該項目進(jìn)展順利，并取得了幾個方面的，設(shè)計、表達(dá)、純化了新型冠狀病毒蛋白，并經(jīng)化學(xué)建構(gòu)后研制成功了新型冠狀病毒的疫苗抗原。
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-11
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在尾礦病毒群落多樣性及其功能角色
通過宏基因組測序獲取了垂直分層尾礦中不同深度的病毒群落基因組，發(fā)現(xiàn)病毒的多樣性和豐度會隨著尾礦深度的增加而增加，在尾礦的表層，前噬菌體（prophage）的相對豐度會顯著升高，表明在更加酸性及寡營養(yǎng)的表層尾礦中，病毒會傾向于更有利于其宿主和自身生存的溶原型生活方式。同時，該研究還比較了表層和深層尾礦中病毒群落功能的差異，發(fā)現(xiàn)表層尾礦中，病毒的功能大多數(shù)無法被注釋，而深層尾礦中病毒的功能大多數(shù)是傳統(tǒng)的與病毒代謝及結(jié)構(gòu)相關(guān)的功能。另外，通過對深層尾礦中病毒同化硫酸鹽還原基因的進(jìn)一步分析，揭示了病毒在深層尾礦的硫循環(huán)中扮演的重要角色。這些分析結(jié)果有助于我們理解自然環(huán)境中病毒與其它微生物以及周圍環(huán)境之間的相互作用，對于酸性尾礦的生態(tài)修復(fù)具有重要的指導(dǎo)意義，同時，該論文也是國際上首次對于尾礦中病毒群落的完整揭示。
中山大學(xué)
2021-04-13
治療白血病的高效溶瘤腺病毒
癌癥已成為公眾健康的重大殺手，每年因癌癥死亡的人數(shù)接近1000萬，傳統(tǒng)的放療、化療由于過高的毒副作用，外科手術(shù)部位有限而難以有效治療，靶向藥物的發(fā)展極大推動了腫瘤治療，然而也存在易產(chǎn)生耐藥性等問題。免疫療法作為新興的腫瘤治療策略，具有精準(zhǔn)打擊、低毒副作用、不易產(chǎn)生耐藥等優(yōu)點逐步受到關(guān)注，其中溶瘤病毒能夠選擇性在腫瘤細(xì)胞中復(fù)制而不破壞正常細(xì)胞，因而具有很大的應(yīng)用前景（詳細(xì)內(nèi)容見前期推送科普系列——溶瘤病毒腫瘤治療）。目前許多溶瘤病毒以實體瘤為治療靶標(biāo)，而應(yīng)用于血液腫瘤的成功案例卻很少。近日，吉林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院于湘暉課題組在國內(nèi)主辦的SCI雜志Signal Transduction and Targeted Therapy上在線發(fā)文，題為“Enhancing the antitumor activity of an engineered TRAIL-coated oncolytic adenovirus for treating acute myeloid leukemia”，該研究構(gòu)建了表達(dá)TRAIL融合蛋白的溶瘤腺病毒，與人參皂苷Rh2聯(lián)用，實現(xiàn)選擇性殺傷血液腫瘤，為白血病的治療提供了新思路。急性髓系白血?。ˋML）是髓系造血干細(xì)胞或祖細(xì)胞的惡性病變，原始細(xì)胞異常增生、分化。盡管一線治療、鞏固化療的方案能夠完全緩解許多患者病癥，但是仍有部分患者無明顯療效，還有一些患者存在復(fù)發(fā)情況，亟需新的治療方式。之前的研究中，研究者曾構(gòu)建了表面展示腫瘤壞死因子相關(guān)凋亡誘導(dǎo)配體（TRAIL）的腺病毒，能夠結(jié)合腫瘤表面死亡受體DR4和DR5，誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡，減弱病毒肝臟趨向性。為了更好評估病毒載體的感染與復(fù)制造成的影響，研究者通過流式細(xì)胞儀分析了病灶內(nèi)分離的AML細(xì)胞上的TRAIL受體（死亡受體DR4/5、誘餌受體DcR1/2）和腺病毒受體（CAR、整合素 αvβ3 和整合素αvβ5），發(fā)現(xiàn)多數(shù)表達(dá)中等水平TRAIL受體，培養(yǎng)細(xì)胞系也有類似現(xiàn)象，而正常粒細(xì)胞、T細(xì)胞這兩類受體表達(dá)很低，因此選擇TRAIL表面展示腺病毒能夠較好進(jìn)行靶向治療。研究者為構(gòu)建溶瘤腺病毒，通過將腺病毒A3衣殼蛋白IX插入“拉鏈結(jié)構(gòu)”，使得TRAIL能夠與“拉鏈結(jié)構(gòu)”偶聯(lián)展示在衣殼蛋白表面。由于只有約17%的衣殼蛋白連接上了TRAIL，研究者試圖采用新的策略：在大腸桿菌中表達(dá)可溶性TRAIL-“拉鏈結(jié)構(gòu)”融合蛋白，再將可溶性的蛋白與病毒粒子孵育，離心后分離表面覆蓋可溶性TRAIL的腺病毒粒子。通過變性凝膠電泳、高效液相色譜、斑點雜交等證實了改造的腺病毒zA4載有活性更高的TRAIL。細(xì)胞實驗也證明zA4相較于原來的版本A3、A4侵染能力、特異性顯著提高。細(xì)胞結(jié)合試驗用于評估侵染活性，證明了攜帶TRAIL顯著促進(jìn)了腺病毒的內(nèi)吞；定量PCR試驗用于評估病毒復(fù)制能力，zA4在癌細(xì)胞中復(fù)制顯著強(qiáng)于其他載體。為有效評估zA4載體抗白血病活性，在不同感染復(fù)數(shù)下以不同載體侵染培養(yǎng)AML細(xì)胞系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)zA4顯著誘導(dǎo)培養(yǎng)細(xì)胞的凋亡。對臨床分離原代AML細(xì)胞深入探究，zA4顯著抑制了大部分AML細(xì)胞的增殖，然而值得注意的是，少部分不表達(dá)死亡受體的細(xì)胞無明顯變化。溶瘤病毒能否在體內(nèi)發(fā)揮作用直接決定了其是否具有臨床價值，基于之前的細(xì)胞實驗，研究者對皮下移植造模小鼠注射了腺病毒載體，發(fā)光成像和病毒基因組分析均證實了載體腫瘤組織靶向性。zA4處理小鼠顯著抑制腫瘤生長，正常器官組織形態(tài)學(xué)、生化特征均未變化，因此未產(chǎn)生肝損傷。同時還觀察到凋亡重要因子caspase-3水平顯著上調(diào)。在更加真實的小鼠白血病模型中，也觀察到相似的結(jié)果，病毒在腫瘤消失后也并不會長時間存在。然而總有一些原代AML細(xì)胞TRAIL表達(dá)量很低，影響zA4的效果。聯(lián)系之前的研究，人參皂苷Rh2能夠誘導(dǎo)白血病細(xì)胞死亡受體表達(dá)和細(xì)胞毒性，研究者就試圖通過Rh2增強(qiáng)TRAIL誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡。通過IC50測定、信號通路分析證實了存在協(xié)同效應(yīng)，在細(xì)胞、小鼠水平上都得到了證實，兩者聯(lián)合使用促進(jìn)白血病腫瘤的凋亡。該研究通過優(yōu)化載體結(jié)構(gòu)、聯(lián)合用藥等方式增強(qiáng)了溶瘤腺病毒的活性，拓寬了溶瘤病毒的潛在適應(yīng)癥范圍，后續(xù)深入的分子機(jī)制探究以及療效的評估將有助于為白血病治療開辟新的道路。
吉林大學(xué)
2021-04-11
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丙肝病毒抑制劑及其制藥用途
本發(fā)明公開了一系列丙型肝炎病毒（HCV）抑制劑及其組合物，并涉及其在制備治療慢性丙型肝炎病毒感染藥物中的應(yīng)用。具體地，本發(fā)明涉及作為NS5A抑制劑的系列化合物及其組合物和制藥用途。
四川大學(xué)
2016-10-12
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近岸海水中有害病毒的檢測
海洋中存在大量病毒，表面海水中病毒的濃度在每毫升105到108之間。海洋病毒能夠侵染多種海洋生物，引起傳染疾病，給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大危害和損失，是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展中急待解決的一大難題。近年來，在海水中檢測到甲肝病毒，因此對人類健康構(gòu)成威脅。海洋病毒的快速檢測以及定量方法，是目前國內(nèi)外正在研究和開發(fā)的現(xiàn)代生物技術(shù)。用PCR技術(shù)對海水中的病毒進(jìn)行檢測，已經(jīng)有一些報道，但僅限于人類腺病毒和少數(shù)其它病毒，我國這方面研究才剛剛起步。對海水病毒進(jìn)行檢測和調(diào)查，可以為海水
南開大學(xué)
2021-04-14
業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
一種檢測淋巴囊腫病毒的PCR方法
本發(fā)明提供一種檢測淋巴囊腫病毒的PCR方法，其中使用的檢測淋巴囊腫病毒的引物，其上下游引物的序列分別為SEQ?ID?NO:1和SEQ?ID?NO:2。本發(fā)明根據(jù)淋巴囊腫病毒基因組序列設(shè)計了大量引物，從中篩選出可快速有效檢測的引物。本發(fā)明所使用的引物具有更高的特異性、靈敏度、實用性及便捷性，能有效的對淋巴囊腫病毒進(jìn)行高靈敏的檢測。
青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-13
NMT細(xì)菌/病毒/組織感染組織能量代謝儀
“NMT界喬布斯”許越先生推薦創(chuàng)新平臺
中關(guān)村NMT產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟推介成員單位創(chuàng)新產(chǎn)品
“生物安全，人人有責(zé)”
推出背景：
在國際競爭白熱化，戰(zhàn)爭形態(tài)多樣化的今天，生物安全已成為國家安全的重要組成部分，為積極應(yīng)對這一挑戰(zhàn)，2019年10月，生物安全法草案于首次提請十三屆全國人大常委會第十四次會議審議。本次新冠肺炎疫情的爆發(fā)，讓各界更加意識到，生物安全對于確保國家安全、保障社會穩(wěn)定、人民群眾生命安全和身體健康的重要性。
國家安全就是國家競爭，歸根結(jié)底又是科技實力的競爭！因此，作為中國的高新技術(shù)企業(yè)，中關(guān)村NMT聯(lián)盟的會員單位，旭月（北京）科技有限公司利用20多年的技術(shù)積累，以NMT：非損傷微測技術(shù)為底層核心技術(shù)，迅速推出了與國家生物安全相關(guān)多種檢驗，監(jiān)測儀器設(shè)備，以及適用于多個學(xué)科及領(lǐng)域的研發(fā)平臺：
《NMT生物安全創(chuàng)新平臺》特制系列產(chǎn)品！
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應(yīng)對挑戰(zhàn)：
1）組織器官水平研究：隨著研究的深入，單細(xì)胞的生理狀態(tài)，以及對不同環(huán)境的生理反應(yīng)，與處于機(jī)體組織器官中的細(xì)胞的差異，已逐漸成為研究中的瓶頸。NMT不僅可以檢測單細(xì)胞，還可以實現(xiàn)對細(xì)胞的原位檢測，以及對活體組織器官的在體檢測，很好地彌補(bǔ)了這一研究手段的空白。
2）活體研究：可在離體或在體的情況下，對活體組織，開展代謝研究，無需提取、無需染色。
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分類及用途：
1）《NMT細(xì)菌感染組織能量代謝儀》（型號：NMT-BTM-100）
基于底層核心NMT技術(shù)，以及成熟的技術(shù)解決方案，讓科研人員可以馬上投入相關(guān)科研創(chuàng)新工作。
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2）《NMT細(xì)菌感染組織能量代謝儀》（型號：NMT-BTM-200）
基于底層核心NMT技術(shù)，結(jié)合自身科研興趣，以及其它相關(guān)技術(shù)參數(shù)，在我方技術(shù)人員協(xié)助下形成技術(shù)解決方案，讓科研人員建立更具獨有創(chuàng)新特色的實驗平臺。
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《NMT細(xì)菌感染組織能量代謝儀》（型號：NMT-BTM-100）
應(yīng)對挑戰(zhàn)：
1）組織器官水平研究：隨著研究的深入，單細(xì)胞的生理狀態(tài)，以及對不同環(huán)境的生理反應(yīng)，與處于機(jī)體組織器官中的細(xì)胞的差異，已逐漸成為研究中的瓶頸。NMT不僅可以檢測單細(xì)胞，還可以實現(xiàn)對細(xì)胞的原位檢測，以及對活體組織器官的在體檢測，很好地彌補(bǔ)了這一研究手段的空白。
2）活體研究：可在離體或在體的情況下，對活體組織，開展代謝研究，無需提取、無需染色。
用途：
基于底層核心NMT技術(shù)，以及成熟的技術(shù)解決方案，讓科研人員可以馬上投入相關(guān)科研創(chuàng)新工作。
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參數(shù)：
1.基本功能：
1.1針對細(xì)菌感染組織能量代謝研究設(shè)計
1.2活體、原位、非損傷檢測
1.3可檢測指標(biāo)：H+、O2
2.性能：
2.1自動化操作
2.2長時間實時和動態(tài)監(jiān)測
2.3無需標(biāo)記
2.4立體3D流速檢測
3.軟件：
3.1imFluxes智能軟件，可直接檢測、輸出離子分子的濃度與流速
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《NMT細(xì)菌感染組織能量代謝儀》（型號：NMT-BTM-200）
應(yīng)對挑戰(zhàn)：
1）組織器官水平研究：隨著研究的深入，單細(xì)胞的生理狀態(tài)，以及對不同環(huán)境的生理反應(yīng)，與處于機(jī)體組織器官中的細(xì)胞的差異，已逐漸成為研究中的瓶頸。NMT不僅可以檢測單細(xì)胞，還可以實現(xiàn)對細(xì)胞的原位檢測，以及對活體組織器官的在體檢測，很好地彌補(bǔ)了這一研究手段的空白。
2）活體研究：可在離體或在體的情況下，對活體組織，開展代謝研究，無需提取、無需染色。
用途：
基于底層核心NMT技術(shù)，結(jié)合自身科研興趣，以及其它相關(guān)技術(shù)參數(shù)，在我方技術(shù)人員協(xié)助下形成技術(shù)解決方案，讓科研人員建立更具獨有創(chuàng)新特色的實驗平臺。
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參數(shù)：
1.基本功能：
1.1針對細(xì)菌感染組織能量代謝研究和研發(fā)設(shè)計
1.2活體、原位、非損傷檢測
1.3可檢測指標(biāo)：H+、O2
1.4可實時監(jiān)測和記錄檢測時的環(huán)境參數(shù)：溫度、濕度、大氣壓、海拔、經(jīng)緯度
1.5 可拓展檢測指標(biāo)：葡萄糖、NADPH、ATP
2.性能：
2.1自動化操作
2.2長時間實時和動態(tài)監(jiān)測
2.3無需標(biāo)記
2.4立體3D流速檢測
3.軟件：
3.1imFluxes智能軟件，可直接檢測、輸出離子分子的濃度與流速，以及檢測時的環(huán)境參數(shù)
旭月（北京）科技有限公司
2021-08-23