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新冠病毒與SARS存在交叉保護(hù)表位的研究
同濟(jì)大學(xué)曹志偉教授團(tuán)隊(duì)與上海市公共衛(wèi)生臨床中心合作，關(guān)于武漢新型冠狀病毒2019-nCoV抗原性計(jì)算的文章（Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus），2020年1月30日在 Journal of Genetics and Genomics在線發(fā)表。 研究表明，S蛋白是冠狀病毒與宿主細(xì)胞表面ACE2受體結(jié)合、進(jìn)而介導(dǎo)病毒入宿主細(xì)胞的關(guān)鍵表面蛋白，是疫苗抗體研發(fā)的重要靶點(diǎn)。基于具有自主知識產(chǎn)權(quán)的免疫原性計(jì)算工具CE-Blast，研究小組對所有冠狀病毒的S蛋白進(jìn)行了系統(tǒng)性的結(jié)構(gòu)模擬和免疫原性掃描，計(jì)算了新病毒與已知17種冠狀病毒亞型之間的免疫原性距離，發(fā)現(xiàn)新病毒S蛋白的免疫原性總體上與SARS更為接近。進(jìn)一步計(jì)算揭示，2019武漢新冠狀病毒與SARS冠狀病毒的S抗原在受體接合區(qū)域（RBD）上存在潛在交叉反應(yīng)表位。最為重要的是，其中一處與人ACE2受體結(jié)合位點(diǎn)緊密毗鄰。因此，針對該表位區(qū)域研發(fā)抗體，空間位阻效應(yīng)可能阻斷病毒與ACE2受體的結(jié)合，有望起到病毒感染保護(hù)作用。同時，針對該表位區(qū)域的SARS抗體，可能對2019新病毒具有潛在臨床治療價值。
同濟(jì)大學(xué)
2021-04-10
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15分鐘新冠病毒感染快檢產(chǎn)品
南京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院與南京大學(xué)校友企業(yè)江蘇美克醫(yī)學(xué)技術(shù)有限公司聯(lián)合研發(fā)出的15分鐘快速檢測新型冠狀病毒感染的IgM/IgG抗體檢測試劑盒(免疫層析法)，已在江蘇省各地市疾病預(yù)防控制中心投入使用。這款試劑盒經(jīng)過南京市第二醫(yī)院等單位的大樣本試用檢測，發(fā)現(xiàn)能夠快速、簡便、準(zhǔn)確的篩查新型冠狀病毒感染患者，完全符合市場的迫切需求。 南京大學(xué)將首批免費(fèi)向淮安市捐贈1萬人份的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒投入人群監(jiān)測。研發(fā)產(chǎn)品 由南京大學(xué)與美克醫(yī)學(xué)聯(lián)合研制成功的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒應(yīng)用了免疫層析法。lgM/lgG抗體是從感染到發(fā)病中出現(xiàn)的人體抗體，是近期感染的標(biāo)志。在感染過程中l(wèi)gM是人體免疫系統(tǒng)中首先出現(xiàn)的抗體，然后lgG抗體出現(xiàn)，伴隨著lgM抗體衰減。檢測急性感染期新型冠狀病毒（2019-nCoV）特異性lgM/lgG抗體具有敏感性高、診斷及時、能判定疑似者是否感染等優(yōu)點(diǎn)。因此，檢測新型冠狀病毒(2019-nCov)lgM抗體具有重要的臨床意義，對有效控制大規(guī)模傳播具有重要的意義。 新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒目前已投入人群監(jiān)測中，在首批試用后，快速、簡便、有效、精準(zhǔn)的病毒檢測效果得到北京疾病預(yù)防控制中心、江蘇省疾病預(yù)防控制中心和華中科技大學(xué)協(xié)和武漢紅十字會醫(yī)院等多省市疾控中心、省傳染病醫(yī)院、多家教學(xué)醫(yī)院20多家醫(yī)療機(jī)構(gòu)的肯定，并積極響應(yīng)加入新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測產(chǎn)品的驗(yàn)證工作中。
南京大學(xué)
2021-04-10
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新冠病毒IgM/IgG抗體聯(lián)合檢測試劑盒
南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院丁丹教授團(tuán)隊(duì)牽頭，聯(lián)合南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院鄭磊教授團(tuán)隊(duì)、華南理工大學(xué)唐本忠院士團(tuán)隊(duì)、深圳金準(zhǔn)生物醫(yī)學(xué)工程有限公司開展聯(lián)合攻關(guān),成功研制出新冠病毒IgM/IgG抗體聯(lián)合檢測試劑盒，并已實(shí)現(xiàn)量產(chǎn)。 1例（63.9%），IgG陽性138例（87.3%），在151例健康對照及非新冠肺炎疾病中特異性為98.7%。
南開大學(xué)
2021-04-10
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氣溫在新冠病毒傳播過程中的影響研究
2020年2月25日，中山大學(xué)的研究人員在預(yù)印本網(wǎng)站 medRxiv 上發(fā)布了一項(xiàng)研究成果，探討了氣溫在新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）傳播過程中的作用，并提出，二者之間可能存在非線性劑量-反應(yīng)關(guān)系，當(dāng)達(dá)到某一溫度時，病毒傳播率最高，隨后溫度的上升或?qū)⒁种撇《镜膫鞑ァ?nbsp; 研究人員收集了2020年1月20日至2月4日期間，我國34個省(包括直轄市、自治區(qū))和26個海外國家共計(jì)429個城市的確診病例數(shù)及每日氣溫，計(jì)算了1月份的平均氣溫、最低氣溫和最高氣溫的日平均值，并利用約束三次樣條函數(shù)和廣義線性混合模型分析了累計(jì)確診病例數(shù)與溫度之間的關(guān)系。模擬方程的計(jì)算結(jié)果顯示，當(dāng)平均氣溫為8.72℃，最低溫度為6.70℃，最高溫度為12.42℃時，累計(jì)確診病例數(shù)達(dá)到峰值。此后，隨著溫度的上升，累計(jì)確診病例數(shù)將下降。 全球COVID-19傳輸?shù)淖罡邷囟扰c累計(jì)確診病例數(shù)（lgN）的三次樣條曲線根據(jù)以上溫度拐點(diǎn)，研究人員將429個城市分為低溫組和高溫組，并采用廣義線性回歸模型進(jìn)一步分析溫度與累計(jì)病例數(shù)之間的關(guān)系。結(jié)果顯示，低溫組中，平均溫度、最低溫度和最高溫度每升高1℃，累積病例指數(shù)分別增加0.83、0.82和0.83。在高溫組中單因素模型中，最低溫度每升高1℃，累積病例指數(shù)就會減少0.86。而當(dāng)溫度達(dá)到30℃時，累計(jì)病例指數(shù)將降至最低。這說明SARS-CoV-2對高溫敏感，溫度的提升能夠阻止病毒擴(kuò)散。此前已有研究表明，SARS-CoV和MERS-CoV等冠狀病毒的傳播與溫度有關(guān)。在22-25℃，相對濕度為40-50%的環(huán)境中，SARS-CoV在光滑的表面上能保持至少5天的活性，而當(dāng)溫度升高到38℃，相對濕度為95%時，病毒很快就會出現(xiàn)失去了活力。同樣，MERS-CoV在低溫、低濕度環(huán)境下，無論是作為固體表面上的液滴還是作為氣溶膠，都可以長期保持其活性。
中山大學(xué)
2021-04-10
業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
茶葉有效成分EGCG對防治新冠病毒的研究
該研究團(tuán)隊(duì)利用創(chuàng)建的植物功效組學(xué)技術(shù)平臺研究發(fā)現(xiàn)，從茶中篩選到的有效單體分子EGCG（表沒食子兒茶素沒食子酸酯）能夠強(qiáng)力結(jié)合新冠病毒S蛋白（Kd=121nM），并有效阻斷新冠病毒S蛋白與人ACE2受體的結(jié)合。同時，研究過程發(fā)現(xiàn)，EGCG不僅能阻止兩者相互結(jié)合，并且對已經(jīng)結(jié)合受體的S蛋白還有促進(jìn)二者解離的作用。目前，國內(nèi)外尚未找到與新冠病毒S蛋白親和力強(qiáng)、并且能夠有效阻斷S蛋白與ACE2結(jié)合的分子。這一發(fā)現(xiàn)為開發(fā)預(yù)防和治療新冠病毒感染的相關(guān)制劑提供了非常有價值的科學(xué)數(shù)據(jù)，同時為從食藥同源植物寶庫中應(yīng)急篩選抗病毒成分并迅速用于臨床提供了一個創(chuàng)新的模式。云南農(nóng)大普洱茶學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室與昆明生物制造研究院有限公司于2020年1月20日聯(lián)合組建了“抗新冠病毒攻關(guān)小組”。研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)發(fā)布的新冠病毒基因序列合成并表達(dá)了5個感染人類的冠狀病毒S蛋白，通過計(jì)算機(jī)模擬篩選方法對110余種藥食物同源植物中的800余種化合物進(jìn)行了初步選擇，從中優(yōu)選出20余種化合物進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。通過分子互作實(shí)驗(yàn)、分子水平阻斷實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)了與S蛋白具有親和力的5個天然化合物。
云南農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-10
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一種新的錄組測序快速建庫方法
基于SHERRY方法的轉(zhuǎn)錄組測序建庫流程如圖1所示，樣本可以來自裂解的單細(xì)胞或bulk RNA；RNA分子經(jīng)過oligo-dT 引物的反轉(zhuǎn)錄后，RNA/DNA雜合鏈可直接被Tn5轉(zhuǎn)座酶打斷（圖中灰色的波浪線及直線分別代表RNA及DNA分子）；在Tagmentation之后，轉(zhuǎn)座酶會在雜合鏈兩端加上adaptor接頭，進(jìn)行之后的建庫PCR擴(kuò)增。 基于100pg的RNA起始量，SHERRY表現(xiàn)出了高的read匹配率，同時可檢測出近9000個基因，其中72%的基因可在三個重復(fù)樣本中檢測出，可重復(fù)性較好。與目前普遍應(yīng)用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的Smart-seq2技術(shù)相比，SHERRY與其建庫質(zhì)量不相上下，并且具較低的GC bias。此外，SHERRY整個流程僅需要5個步驟，且可在一個管子中完成，整個時間僅約4小時，其中手工操作時間不到半小時。相比之下，Smart-seq2整個耗時約為SHERRY二倍的時間，且需要一些前處理等操作；此外，包含十個步驟的NEBNext方法則需要更加多的實(shí)驗(yàn)室操作和時間成本。值得一提的是，在成本方面，SHERRY方法僅為其他兩種方法的五分之一，將大大節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本。
北京大學(xué)
2021-04-10
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新冠肺炎疫情數(shù)據(jù)導(dǎo)航、防控態(tài)勢及溯源研究
為服務(wù)社會大眾了解疫情走勢，并為相關(guān)部門提供決策支持，北京航空航天大學(xué)北航大數(shù)據(jù)與腦機(jī)智能高精尖創(chuàng)新中心劉旭東教授、胡春明教授、李建欣教授等組織師生，與復(fù)雜系統(tǒng)可靠性實(shí)驗(yàn)室李大慶研究員聯(lián)合組成團(tuán)隊(duì)，全力投入建模和系統(tǒng)研發(fā)，已向決策部門提供疫情數(shù)據(jù)評估與預(yù)警報告、區(qū)域物資保障評估專項(xiàng)報告等，并迅速開發(fā)“新冠肺炎疫情數(shù)據(jù)導(dǎo)航服務(wù)”平臺，數(shù)據(jù)單日訪問量近 5 萬次。此外，中心還進(jìn)行新型冠狀病毒的疫情評估與預(yù)測報告并開發(fā)疫情實(shí)時更新系統(tǒng)。中心對疫情現(xiàn)狀進(jìn)行分析和預(yù)測，為公眾提供及時、準(zhǔn)確的疫情態(tài)勢分析、走勢預(yù)測、輿情動態(tài)和政策措施等智能數(shù)據(jù)服務(wù)，實(shí)現(xiàn)全國及重點(diǎn)城市日度傳播系數(shù)計(jì)算、短期確診人數(shù)預(yù)測和長期疫情拐點(diǎn)與結(jié)束日期預(yù)測、疫情緩解系數(shù)評估等功能。此外，大數(shù)據(jù)與腦機(jī)智能高精尖創(chuàng)新中心研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)疫情確診患者相關(guān)公開數(shù)據(jù)，利用自然語言處理等技術(shù)，從已公開全國各省市直轄區(qū)四千余位確診患者軌跡中抽取了基本信息(性別、年齡、常住地、工作、接觸史等)、軌跡(時間、地點(diǎn)、交通工具、事件)及病患關(guān)系形成結(jié)構(gòu)化信息。同時開發(fā)確診患者軌跡可視化查詢與分析系統(tǒng)，為疫情傳播與防控相關(guān)研究提供有效支撐。
北京航空航天大學(xué)
2021-04-10
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用相關(guān)病毒模型篩選抗2019新冠病毒老藥
病毒的同源性包括基因組核苷酸序列的同源，也包括蛋白質(zhì)氨基酸序列的同源。在序列比對方面，穿山甲冠狀病毒與新冠病毒在氨基酸序列同源性方面超過90%的相似度。對于藥物篩選來說，蛋白質(zhì)氨基酸序列的同源性越高，意味著病毒生命活動的方式越相近，可以形象地理解為，兩個病毒的“行為方式”非常一致。這種“行為方式”與新冠病毒極為相似的病毒，能不能替代新冠病毒用于藥物篩選呢？童貽剛敏銳地意識到：如果可以，那么“篩藥”工作將在針對新冠病毒的同時，也保障了實(shí)驗(yàn)的安全性，篩藥工作將走出高安全等級實(shí)驗(yàn)室，走進(jìn)普通P2實(shí)驗(yàn)室。
北京化工大學(xué)
2021-04-10
15分鐘新冠病毒感染快檢產(chǎn)品
由南京大學(xué)與美克醫(yī)學(xué)聯(lián)合研制成功的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒應(yīng)用了免疫層析法。lgM/lgG抗體是從感染到發(fā)病中出現(xiàn)的人體抗體，是近期感染的標(biāo)志。在感染過程中l(wèi)gM是人體免疫系統(tǒng)中首先出現(xiàn)的抗體，然后lgG抗體出現(xiàn)，伴隨著lgM抗體衰減。檢測急性感染期新型冠狀病毒（2019-nCoV）特異性lgM/lgG抗體具有敏感性高、診斷及時、能判定疑似者是否感染等優(yōu)點(diǎn)。因此，檢測新型冠狀病毒(2019-nCov)lgM抗體具有重要的臨床意義，對有效控制大規(guī)模傳播具有重要的意義。
南京大學(xué)
2021-04-10
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新冠肺炎病毒傳播在建筑中的影響和控制
關(guān)于新冠肺炎病毒傳播在建筑中的影響和控制建議”的研究分析，由東南大學(xué)建筑學(xué)院建筑技術(shù)與科學(xué)研究所副教授李永輝及其團(tuán)隊(duì)完成。在當(dāng)前疫情防控和部分企業(yè)復(fù)工在即的形勢下，對停留時間長、室內(nèi)人員密度大、感染風(fēng)險高的住宅、辦公樓和醫(yī)院三類建筑使用中的疫情防控進(jìn)行了研究分析。基于三種建筑類型的使用特點(diǎn)、室內(nèi)人員活動特征、空調(diào)系統(tǒng)的設(shè)計(jì)、設(shè)備運(yùn)行的管理優(yōu)化措施等角度，對新型冠狀病毒傳播的預(yù)防與控制進(jìn)行了研究分析并提出建議措施，助力疫情防控，并以期能夠?qū)罄m(xù)同類型建筑的規(guī)劃設(shè)計(jì)提供參考。該研究分別從以下方面進(jìn)行研究分析并提供建議：1.住宅建筑?廚房排煙道；空調(diào)系統(tǒng)；電梯；樓梯間。2.辦公建筑辦公建筑內(nèi)空調(diào)系統(tǒng)的合理使用；全空氣空調(diào)系統(tǒng)及其使用策略；風(fēng)機(jī)盤管加新風(fēng)系統(tǒng)及其使用策略；多聯(lián)機(jī)及分體式空調(diào)與其使用策略；辦公建筑的應(yīng)急管理措施建議；辦公人員的自我防護(hù)建議。3.醫(yī)院建筑醫(yī)院手術(shù)室；傳染病專用門診科室；專用隔離區(qū)域；普通科室及其他區(qū)域；基于新型肺炎疫情對醫(yī)院空調(diào)系統(tǒng)設(shè)計(jì)及運(yùn)行管理方面的建議。新建醫(yī)院建筑空調(diào)系統(tǒng)設(shè)計(jì)建議，既有醫(yī)院建筑空調(diào)系統(tǒng)在疫情期間運(yùn)行建議。
東南大學(xué)
2021-04-10