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揭示RNA編輯核心蛋白ADAR全轉錄組RNA底物特征

2021-04-13 00:00:00
云上高博會 http://www.c05ze3x.xyz
關鍵詞: RNA ADAR
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所屬領域:
生物、醫藥及醫療機械
項目成果/簡介:

開發了一個高效的捕獲RNA結合蛋白雙鏈RNA底物的建庫測序技術(irCLASH)以及后續的一整套生物信息學分析方法;首次在轉錄組水平上系統地繪制了人類ADAR蛋白的內源雙鏈RNA底物圖譜;揭示了決定ADAR結合效率和編輯效率的底物特征和ADAR結合長雙鏈RNA的體內模型。

       該研究利用irCLASH技術系統構建和分析了人類ADAR1、ADAR2及ADAR3的雙鏈RNA底物圖譜,發現與之前根據計算推導的研究設想不同,ADAR具有大量的、長距離的雙鏈RNA底物。該研究發現不完全互補配對的底物與ADAR蛋白也有很好的親和度,特別是ADAR2家族成員。研究還進一步揭示了決定ADAR結合效率和編輯效率的底物特征。irCLASH測序技術及后續的整套生物信息學分析方法的開發為研究雙鏈RNA結合蛋白的內源底物提供了新的工具。同時,該研究揭示的ADAR與底物相互作用及催化特性為研究人員開發高效的RNA編輯工具提供了資源寶庫及改進方向。

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